Simulation digestion enzymatique

Ce simulateur de digestion enzymatique permet de réaliser une digestion in silico de protéines afin de prédire les peptides générés selon l’enzyme de clivage sélectionnée. Il constitue un outil d’aide à l’analyse en protéomique, notamment pour l’interprétation des données de spectrométrie de masse.

Le simulateur offre la possibilité de calculer les masses des peptides sous forme de masse moyenne ou de masse monoisotopique (exacte), permettant ainsi une adaptation aux différents types d’instruments analytiques. L’utilisation de la masse moyenne est recommandée pour les spectromètres de masse à faible pouvoir résolutif, tandis que la masse monoisotopique est plus appropriée pour les instruments à haut pouvoir résolutif, en raison de leur précision massique élevée.

Simulation de la digestion enzymatique des protéines

Peptides générés avec modifications fixes et dynamiques
AA autorisés : ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY
Modifications fixes
Appliquées systématiquement lorsque les sites sont présents.

Modifications dynamiques
Appliquées si sélectionnées (sur tous les sites présents dans le peptide).
Peptide Modifs Start End Len Mass m/z (1..Zmax)